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个人简介
谢然,特聘研究员,博士生导师 。2010年本科毕业于上海交通大学化学化工学院,2015年毕业于北京大学化学院化学生物学系,获博士学位(导师:陈兴 教授,研究方向为化学糖生物学)。2019年12月加入南京大学化学化工学院化学生物学学科,同时加入南京大学化学和生物医药创新研究院(ChemBIC),开始独立科研工作。 更多信息请在微信中搜索“谢然课题组”。
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工作经历
2015年至2019年在美国哈佛大学 (Havard University) 化学与化学生物学系从事博士后研究工作(合作导师为美国两院院士Daniel Kahne教授,研究方向为革兰氏阴性菌脂多糖的转运机理探究)。 展示全部
研究方向
1) 新型非天然糖代谢标记探针的开发及应用 2) 疾病模型中的糖分析检测及生物学功能阐释 3) 基于非天然氨基酸插入技术的糖酶改造及功能调控 4) 革兰氏阴性菌脂多糖转运蛋白的体外重构及功能解析 学术成果
2025 1. Liu, C., Zhang, H., Mao, J. et al. Mevalonate metabolites boost aged oocyte quality through prenylation of small GTPases. Nat Aging (2025). https://doi.org/10.1038/s43587-025-00946-7 2. Wang, Yichun, et al. Glycan Covalent Targeting Chimera‐Based T‐Cell Glycoengineering for Boosting Immunotherapy. Chemistry–A European Journal 31.30 (2025): e202500364. https://doi.org/10.1002/chem.202500364 2024 1. Meng, Xiangfeng, Yue Zhou, Lei Xu, Limu Hu, Changjiang Wang, Xiao Tian, Xiang Zhang et al. O-GlcNAcylation Facilitates the Interaction between Keratin 18 and Isocitrate Dehydrogenases and Potentially Influencing Cholangiocarcinoma Progression. ACS Central Science 10, no. 5 (2024): 1065-1083. 2.Guo, Linru, Yida Han, Hong Yang, Jie Fu, Wang Li, Ran Xie, Yuanjian Zhang, Kang Wang, and Xing-Hua Xia. Single-Molecule Discrimination of Saccharides Using Carbon Nitride Nanopores. Nano Letters 24, no. 18 (2024): 5639-5646. 3.Yao, Yunyan, Ru Jia, Chuanming Liu, Haiqi Wang, Ting Li, Xiaocui Zheng, Tong Zhong et al. An in‐situ‐tag‐generation proximity labeling technology for recording cellular interactions. Angewandte Chemie (2024): e202407109. 4. Wang, G., Wang, Y., Wang, L., Wu, S., Cao, A., Pu, W., Li, T., Xie, R., Wang, H., Ding, L. and Ju, H., 2024. Stressor-Actuated Proximity Labeling for Reporting Cellular Interaction. Analytical Chemistry. 5. Xu, L., Zhao, W., Wang, R., Hong, M., Wang, H., Sun, Y., Zhong, T., Hang, D., Xie, R., Chen, L. and Yao, B., 2024. Aglycone Analysis and Quantitative Tracking of Correlated Terminal Glycan Pair on Spermatozoa. Analytical Chemistry, 96(41), pp.16186-16194. 6. Xu, H., Ye, J., Zhang, K.X., Hu, Q., Cui, T., Tong, C., Wang, M., Geng, H., Shui, K.M., Sun, Y. and Wang, J., 2024. Chemoproteomic profiling unveils binding and functional diversity of endogenous proteins that interact with endogenous triplex DNA. Nature Chemistry, 16(11), pp.1811-1821. 2023 1. Xiao Tian; Lingna Zheng; Changjiang Wang; Yida Han; Yujie Li; Tongxiao Cui; Jialin Liu; Chuanming Liu; Guogeng Jia; Lujie Yang; Yi Hsu; Chen Zeng; Lijun Ding; Chu Wang; Bo Cheng; Meng Wang*; Ran Xie*(2023) Selenium-based metabolic oligosaccharide engineering strategy for quantitative glycan detection, Nature Communications, 14(1) 8281, https://doi.org/10.1038/s41467-023-44118-w 2. Yihong Zhong, Lijia Xu, Chen Yang, Le Xu, Guyu Wang, Yuna Guo, Songtao Cheng, Xiao Tian, Changjiang Wang, Ran Xie, Xiaojian Wang, Lin Ding, Huangxian Ju (2023). Site-selected in situ polymerization for living cell surface engineering. Nature Communications, https://doi.org/10.1038/s41467-023-43161-x 3. Yi Man,# Di Lu# and Ran Xie* (2023). State-of-the-Art Imaging Tool Portray the Role of GlycoRNAs in Cancer-and Immuno-Biology. (Viewpoint). Chem. Biomed. Imaging2023, 1, 7, 667-669.,https://doi.org/10.1021/cbmi.3c00099 4. Xiaocui Zheng, Yiran Li, Tongxiao Cui, Jing Yang, Xiangfeng Meng, Haiqi Wang, Liusheng Chen, Jian He, Nan Chen, Liying Meng,* Lin Ding,* and Ran Xie* (2023). Traceless Protein-Selective Glycan Labeling and Chemical Modification. J. Am. Chem. Soc., https://doi.org/10.1021/jacs.3c07889 5. Xiaocui Zheng, Boqiang He, Liying Meng,* and Ran Xie* (2023). Recent Advances in Protein-Specific Glycan Imaging and Editing. ChemBioChem, https://doi.org/10.1002/cbic.202200778 6. Jing Yang,# Kefan Wang,# Shanyu Zhang, Xiaocui Zheng, Tongxiao Cui, Xian Yang, Yao Liu, Di Lu, Yuqin Wang, Xiao Tian, Panke Zhang, Shuo Hunag,* and Ran Xie* (2023). Site-Specific Introduction of Bioorthogonal Handles to Nanopores by Genetic Code Expansion. Angewandte Chemie International Edition, https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/anie.202216115 7.Zhong, Tong, Younan Chen, Xiaomin Yan, Yiran Li, Haiqi Wang, Yihong Zhong, Ke Li et al. A Patching and Coding Lipid Raft-Localized Universal Imaging Platform. Chemical & Biomedical Imaging 2, no. 2 (2023): 135-146. 2022 1. Tongxiao Cui,# Yi Man,# Feifei Wang, Shuyang Bi, Liang Lin,* Ran Xie* (2022). Glycoenzyme Tool Development: Principles, Screening Methods, and Recent Advances. Chinese Journal of Chemistry, https://doi.org/10.1002/cjoc.202100770 2. Wang, Feifei,# Hao Kong,# Xiangfeng Meng, Xiao Tian, Changjiang Wang, Lei Xu, Xiang Zhang, Lei Wang,* and Ran Xie* (2022). A light-initiated chemical reporter strategy for spatiotemporal labeling of biomolecules. RSC Chemical Biology, https://doi.org/10.1039/D2CB00072E 3. Anwen Mao, Yan Zhang, Guyu Wang, Tong Zhong, Xinyu Chen, Haiqi Wang, Ran Xie,* Xiaojian Wang, Lin Ding,* Huangxian Ju (2022). Aglycone sterics-selective enzymatic glycan remodeling. iScience, https://doi.org/10.1016/j.isci.2022.104578 4. Minglun Liu, Yuncong Chen,* Yan Guo, Hao Yuan, Tongxiao Cui, Shankun Yao, Suxing Jin, huanhuan Fan, Chengjun Wang, Ran Xie, Weijing He,* Zijian Guo* (2022) Golgi apparatus-targeted aggregation-induced emission luminogens for effective cancer photodynamic therapy. Nature Communications, https://doi.org/10.1038/s41467-022-29872-7 Prior to NJU 1. Ran Xie, Rebecca J. Taylor and Daniel Kahne (2018). Outer Membrane Translocon Communicates with Inner Membrane ATPase To Stop Lipopolysaccharide Transport. J. Am. Chem. Soc., 140 (40), 12691-12694. 2. Yuting Sun, Senlian Hong, Ran Xie, Rongbing Huang, Ruoxing Lei, Bo Cheng, Deen Sun, Yifei Du, Corwin Nycholat, James Paulson and Xing Chen (2018). Mechanistic Investigation and Multiplexing of Liposome-Assisted Metabolic Glycan Labeling. J. Am. Chem. Soc., 140 (10), 3592–3602. 3. David J. Sherman*, Ran Xie*, Rebecca J. Taylor*, Alex H. George*, Suguru Okuda*, Peter J. Foster*, Daniel J. Needleman and Daniel Kahne (2018). Lipopolysaccharide is transported to the cell surface by a membrane-to-membrane protein bridge. Science. 359 (6377), 798-801. *Authors contributed equally. 4. Yifei Du, Ran Xie, Yuting Sun, Xinqi Fan and Xing Chen (2017). Liposome-assisted metabolic glycan labeling with cell and tissue selectivity. Meth. in Enzymol., 598:321-353. 5. Eileen Moison, Ran Xie, Ge Zhang, Matthew D. Lebar, Timothy C. Meredith, and Daniel Kahne (2017). A Fluorescent probe distinguishes between inhibition of early and late steps of lipopolysaccharide biogenesis in whole cells. ACS Chem. Biol.,12 (4), 928-932. 6. Gong Zhang, Jie Li, Ran Xie, Xinyuan Fan, Yanjun Liu, Siqi Zheng, Yun Ge and Peng Chen (2016). Bioorthogonal chemical activation of kinases in living systems. ACS Cent. Sci., 2(5), 325-331. 7. Ran Xie, Lu Dong, Rui Hua, Chen Zhang and Xing Chen (2016). In vivo metabolic labeling of sialoglycans in the mouse brain by using a liposome-assisted bioorthogonal reporter strategy. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 113(19), 5173-5178. 8. Bo Cheng, Ran Xie, Lu Dong and Xing Chen (2016). Metabolic remodeling of cell-surface sialic acids: principles, applications, and recent advances. ChemBioChem, 17(1), 11-27. 9. Liang Lin, Ling Liu, Ran Xie, Bing Zhao, Wei Lin, Minlong Shi, Ye-Guang Chen, Timothy A. Springer and Xing Chen (2015). Carbon nanotube-assisted optical activation of TGF-β signaling by near-infrared light. Nat. Nanotech., 10, 465-471. 10. Ran Xie, Lu Dong, Rongbing Huang, Senlian Hong, Ruoxing Lei and Xing Chen (2014). Targeted imaging of tumor-associated glycans in living animals. Angew. Chem. Int. Ed., 53(51), 14082-14086. 11. Ran Xie, Senlian Hong and Xing Chen. (2013). Cell-selective metabolic labeling of biomolecules with bioorthogonal functionalities. Curr. Opin. Chem. Biol. 17(5), 747-752. 12. Ran Xie, Senlian Hong, Lianshun Feng, Jie Rong and Xing Chen. (2012). Cell-selective metabolic glycan labeling based on ligand-targeted liposomes. J. Am. Chem. Soc., 134(24), 9914-9917. 13. Sara H. Rouhanifard*, Ran Xie*, Guoxin Zhang, Xiaoming Sun, Xing Chen and Peng Wu. (2012). Detection and isolation of dendritic cells using Lewis X-functionalized magnetic nanoparticles. Biomacromolecules, 13(10), 3039-3045. *Authors contributed equally. 14. Li Lin, Ran Xie, Shaoai Xie, Nenghu Fang. (2010). Separation and quantitative analysis of microcystins in water using micro-column HILIC. Research and Exploration in Laboratory, 29(11), 203-205. 15. Ran Xie, Ziming Zhao, Xiaorong Dang. (2010). Progress in research of polyurethane/carbon nanotubes composites. China Synthetic Rubber Industry, 33(3), 238-243. 著作: 《中国学科发展战略·化学生物学》,科学出版社,ISBN 978-7-03-043399-2 课程名称、上课时间地点
春季学期 (本科生、硕士生) 13010270T 《化学生物学综合实验》 周四3-8节 基础实验楼 13030210 《化学文献与科学方法》 周一9-10节 仙II-111 13031080 《糖科学基础》 周一7-8节 仙I-408 秋季学期(博士生) 070303B02 《化学生物学》 070306X01 《化学生物学研究前沿》 070306X02 《化学生物学学术思维培养》 070306X03 《化学生物学科学研究与科学方法》 教学大纲、考试要求
《糖科学基础》《化学文献与科学方法》教学大纲 《糖科学基础》教学大纲 课程名称:糖科学基础 (Introduction to Glycoscience) 课程编号:任课教师:谢然 课内学时:32学分:2 开课时间段: 一.课程简介 本课程授课对象为化学化工学院、生命科学学院、现代工程与应用科学学院等的本科生和硕士生,学制一个学期,每周2学时。本课程的主要目的是概述糖科学(糖化学生物学、糖生物学、糖化学)中的基本事实、概念和研究方法。课程围绕该领域的主要主题内容展开,从对碳水化合物的结构与分子相互作用的基本认知开始,到它们的分类、组装及合成机理,在正常和疾病状态下的生物学功能,以及在化学生物学、药物化学、材料科学中的应用。本课程面向对该领域具有科学兴趣的本科生和研究生,并且提供部分阅读材料及课堂笔记。 二.选课学生要求 化学、生物、医学、工程、环境等专业的本科生和硕士生,具有一定有机化学和/或生物化学基础,鼓励同时选修分子生物学、细胞生物学等基础课程。 三.教材及推荐参考书 教材:
推荐参考书:
四.课程主要内容与学时分配
第11周-第14周 糖相关专家报告(8学时) 授课导师根据需要,邀请糖相关领域专家进行主题报告。 第15-16周 糖科学论文演讲报告 (2学时) 学生根据人数分组,选择过去6个月内发表的与糖科学领域有关的原始论文,通过多媒体形式进行介绍,听众根据内容提出问题并进行批判性讨论。要求如下:
五.授课形式和成绩考核 成绩考核: 作业+考勤(2次,40%)、糖科学论文演讲报告(25%)、 最终项目(25%),教师浮动评价(10%) 最终项目 最终项目的目标是通过在本科及研究生科恒中广泛传播糖科学这一主题,从而提高学生对于聚糖重要性的认识。学生选择一个主题(可以不限于以下主题),以教学幻灯片或视频形式介绍选择的领域与糖科学的相关性以及自身的感受,时间在10min以内。有鉴于授课老师不一定是学生感兴趣领域的专家,请在介绍中提供适当的背景信息。最终以.MP4形式提交。 最终项目主题示例:
第15-16周 糖科学论文演讲报告 (2学时) 学生根据人数分组,选择过去6个月内发表的与糖科学领域有关的原始论文,通过多媒体形式进行介绍,听众根据内容提出问题并进行批判性讨论。要求如下:
《化学文献与科学方法》本科生课程教学大纲 课程编号:负责教师: 谢然 课内学时:32学分:2 一、课程简介 本课程授课对象为化学化工学院本科生,在本课程中,你将完整学习关于化学文献的方方面面,以帮助你早日了解化学专业科研工作的要点,在未来硕士/博士的学习过程中取得更大的成功。 二、课程主要内容与学时分配: 第一部分 科学研究一般流程及基本要素 (2学时) 第一周 科学与科学方法(2学时)
第二部分 化学文献 (20学时) 第二周 科学信息收集与数字化-1(2学时)
第三周 科学信息收集与数字化-2(2学时)
第四周 文献阅读与品鉴-1(2学时)
第五周 批判性文献阅读与品鉴-2(2学时)
第六周 推理与论证(2学时)
第七周 科学论证(2学时)
第八周 论文写作及论文报告指导原则-1(2学时)
第九周 论文写作及论文报告指导原则-2(2学时)
第十周 科研辅助工具及科学演讲-1(2学时)
第十一周 科研辅助工具及科学演讲-2(2学时)
第三部分 科学方法 (10学时) 第十二周 学术文化中的批判性思维介绍 (2学时)
第十三周 科学研究从问题开始(2学时)
第十四周 实验设计、数据收集及分析(2学时)
第十五周 案例研究(2学时) 教师以自己的科研经历为例,介绍化学文献和科学方法的基本应用。 第十六周 科学交流与科学看世界(2学时)
期末考试-论文演讲报告 学生选择过去6个月内发表的与化学相关领域有关的原始论文,通过录制视频形式进行介绍,时间为30min。要求如下:
课程反馈及考试内容提交
三、参考书目: 1. 网络公开课 中国科技大学网络公开课程《文献管理与信息分析》 2. Understanding Science, https://undsci.berkeley.edu/ 3. Critical Thinking Skills for University Success, University of Sydney, Coursera 四、成绩考核
教学资源(上课讲义、参考资料等)
课题组风采
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